Z komunikatu Komisji Odwoławczej ds. Licencji Klubowych PZPN oraz Departamentu Rozgrywek Krajowych PZPN wynika, że “Pomimo złożonego w terminie odwołania klubu Zawisza Bydgoszcz od decyzji nr 14/1 Komisji ds. Licencji Klubowych PZPN z dnia 30 maja 2016 roku o nieprzyznaniu Klubowi licencji na udział w rozgrywkach I ligi w sezonie 2016/2017, (…) Komisja Odwoławcza postanowiła pozostawić odwołanie Klubu bez rozpoznania ? Odwołanie nie spełniało wymogów formalnych przewidzianych w Podręczniku Licencyjnym”.
W tej sytuacji decyzja Komisji ds. Licencji Klubowych PZPN z dnia 30 maja 2016 roku o nieprzyznaniu klubowi Zawisza Bydgoszcz licencji na rozgrywki I ligi w sezonie 2016/2017 pozostała w mocy. Zgodnie z decyzją komisji Zawisza Bydgoszcz będzie mógł się teraz ubiegać o licencję na udział w rozgrywkach II ligi w sezonie 2016/2017. Formalnie zatem Zawisza jest klubem II-ligowym bez licencji na występy w tej klasie rozgrywkowej.
W konsekwencji PZPN odwołał mecze barażowe o udział w rozgrywkach I ligi pomiędzy drużynami MKS Kluczbork i Wisły Puławy. Ten pierwszy zespół utrzymał się mimo zajętego 15. miejsca w tabeli w I lidze, a ten drugi choć zajął w II lidze 4. miejsce bez barażu awansował do I ligi.